1960
1月,上海古旧书店党支部改选，书记阎脉文，副书记丁之翔。 
1月1日,根据上海市出版局指示，将原由黄浦区文化局领导的上海古旧书店（包括所属古籍书店、上海旧书店及荣宝斋）、外文书店和虹口区、静安区、卢湾区的上海旧书店门市部及卢湾区的友谊书店合并成立上海图书公司，归上海市出版局领导。 
11月,公司所属荣宝斋改归上海人民美术出版社领导，与该社筹建的朵云轩木刻水印工场合并。  
又据上海市出版局指示，撤销上海图书公司，分别成立上海古旧书店和上海外文书店，由市出版局领导。上海古旧书店由阎脉文任经理，王子澄、刘季康、丁之翔任副经理。     上海古籍书店首次利用旧木刻版片刷印的《龙溪精舍丛书》出版。
    古籍书店收购到宋刻本古籍一批，内有《紫云先生增修校正押韵释疑》《附释文互注礼部韵略》《会嵇三赋》《孟子或问纂要》《欧阳修年谱》等。
    上海旧书店收购到革命书刊一批，其中有瞿秋白译《无产阶级的哲学—唯物论》、萧楚女著《社会科学概论》、恽代英编著《政治学概论》和《中国国民党与劳动运动》、1924年至1925年出版的《反帝国主义运动大同盟会刊》1至8期。 

1962
2月,上海古旧书店第一批影印的字帖《柳公权书玄秘塔》等3种出版。开始影印出版《天一阁藏明代方志选刊》，本年度出版28种，到1965年共出版107种。
2月3日,上海市出版局发出上海古旧书店干部配备批示，由阎脉文任经理，王子澄、刘季康、丁之翔任副经理。 
10月,阎脉文任公司党支部书记，庄同善任副书记。 

1963
上海古籍书店收购到明代万历刻本《古本董解元西厢记》（现藏上海图书馆）。
    编印《革命书刊伪装本目录》，共收本店收购到的伪装本书刊187种。
    刷印《嘉业堂丛书》。

1964
10月3日,上海旧书店东大名路门市部（东大名路1178号）开业。
11月,刷印《吴兴丛书》《嘉业堂金石丛书》等。

1965
4月15日,上海市出版局批复：一、木版古籍刷印工作仍可由上海古旧书店继续进行。二、方志影印可由“中华上编”负责，由上海古旧书店负责发行。三、成套期刊的缺本可仍由上海古旧书店复印。四、印刷字帖的工作仍根据以前上海古旧书店与朵云轩、上海教育出版社的分工原则办理。 
8月,开始影印原商务印书馆出版的《东方杂志》。
    据统计，从1956年设立古籍书店和上海旧书店开始至1965年的十年间，共收购到各类古旧书刊5000多万册，其中珍本善本古籍4800多种，各种稀见珍贵的革命进步书刊8000多册。 

1966
4月,上海古籍书店用晒图方式复制古籍，至当月共复制古书44部138册。 

1967
4月1日,上海古旧书店改名上海书店。 
12月,上海书店划归上海新华书店领导。 

1968
1968年,上海书店原有古籍、旧书、期刊三个门市部合并为一 个门市部，经营新书及少量旧科技书。