夏文化研究项目
  河南省方城县八里桥遗址
  河南省洛阳市二里头遗址
长江中游文明进程研究（夏商周）项目
  安徽省淮南市武王墩墓地
长江下游区域文明模式研究项目
  浙江省杭州市良渚古城及水利系统遗址
  江苏省张家港市东山村遗址、常州市寺墩遗址
  安徽省含山县凌家滩遗址
长江中下游早期稻作农业社会的形成研究项目
  浙江省衢州市皇朝墩遗址
川渝地区巴蜀文明进程研究项目
  四川省广汉市三星堆遗址
其他研究项目
  江苏省兴化市草堰港遗址
  山西省昔阳县钟村墓地
  河南省安阳市殷墟遗址
  浙江省绍兴市稽中遗址
  江苏省盐城市盐业考古
  河南省开封市北宋东京城景龙门遗址
  江苏省淮安市城市考古
  海南省三沙市南海西北陆坡一号、二号沉船遗址