理论篇
1 DNA的结构
1.1 DNA结构的发现
1.2 DNA的一级结构
1.3 DNA的二级结构
1.4 DNA结构的多态性
1.5 DNA的性质
2 DNA损伤的原因
2.1 外源性因素
2.2 内源性因素
3 常见DNA损伤类型
3.1 嘌呤损伤
3.2 嘧啶损伤
3.3 断裂和交联
4 DNA损伤的修复
4.1 碱基切除修复
4.2 核苷酸切除修复
4.3 错配修复
4.4 双链断裂修复
5 单分子技术在DNA损伤研究中的应用
5.1 单细胞凝胶电泳分析
5.2 荧光探针与标记方法
5.3 荧光共振能量转移
5.4 原子力显微镜
5.5 全内反射荧光显微镜
5.6 单分子磁镊
6 分子动力学模拟在DNA损伤研究中的应用
6.1 分子动力学
6.2 马尔可夫模型
实验篇
7 DNA嘧啶过氧自由基对C-H键反应活性的研究
7.1 引言
7.2 研究方法
7.3 结果与讨论
7.4 本章小结
8 5R-Tg对DNA双螺旋结构的影响
8.1 引言
8.2 研究方法
8.3 结果与讨论
8.4 本章小结
9 5S-Tg对DNA双螺旋结构的影响
9.1 引言
9.2 研究方法
9.3 结果与讨论
9.4 本章小结
10 修复蛋白hNEIL1对Tg:A碱基对的识别
10.1 引言
10.2 研究方法
10.3 结果与讨论
10.4 本章小结
11 A-DNA中碱基的翻转
11.1 引言
11.2 研究方法
11.3 结果与讨论
11.4 本章小结
12 分子动力学模拟在生物化学教学中的探索
12.1 引言
12.2 建立模型
12.3 模拟步骤
12.4 结果与讨论
12.5 本章小结
13 胸腺嘧啶二醇5R,6S异构体稳定构型的理论研究
13.1 引言
13.2 模型与计算方法
13.3 结果与讨论
13.4 NBO及氢键相互作用能分析
13.5 本章小结
主要参考文献
附录A DNA嘧啶过氧自由基对C-H键反应活性的研究
附录B 5R-Tg对DNA双螺旋结构的影响
附录C 5S-Tg对DNA双螺旋结构的影响
附录D 修复蛋白hNEIL1对Tg:A碱基对的识别
附录E 拟合得到的参数
附录F A-DNA中碱基的翻转