第一章  绪论
第二章  生物学网络
  第一节  图论基础
  第二节  网络模型
  第三节  基因表达调控网络
  第四节  蛋白质相互作用网络
  第五节  代谢网络
  第六节  信号网络
  第七节  疾病与网络
  第八节  网络药理学
  第九节  机器学习与生物网络
第三章  DNA系统
  第一节  DNA的研究历程
  第二节  DNA的结构和功能组成
  第三节  DNA组学及检测技术
  第四节  DNA系统与人类疾病
第四章  RNA系统
  第一节  RNA的研究历程
  第二节  RNA的结构与分类
  第三节  RNA功能与疾病发生
  第四节  RNA相关实验方法及检测技术
  第五节  面临的问题和挑战
第五章  蛋白质系统
  第一节  蛋白质相互作用系统概述
  第二节  蛋白质相互作用的结构基础
  第三节  结构域与蛋白质作用界面
  第四节  蛋白质相互作用检测技术
  第五节  蛋白质相互作用及相互作用组的数据库
  第六节  蛋白质与核酸的相互作用
第六章  代谢组学
  第一节  代谢组学的基本特点
  第二节  代谢组学的应用
  第三节  代谢组学的工作流程
  第四节  代谢组学的案例研究
  第五节  代谢工程与合成生物学
第七章  糖组学
  第一节  糖基化反应网络与数据采集
  第二节  糖组学建模
  第三节  糖基化反应网络的先验、模拟与优化
  第四节  模拟后分析：生成假设
  第五节  糖组学进展
第八章  生物学数据库
  第一节  生物学数据库简介
  第二节  综合数据库
  第三节  系统组分数据库
  第四节  互作数据库
第九章  机器学习在系统生物学中的应用
  第一节  概述
  第二节  机器学习在基因组中的应用
  第三节  机器学习在转录组中的应用
  第四节  机器学习在蛋白质组中的应用
  第五节  技术挑战和未决问题
第十章  表观遗传系统
  第一节  表观遗传修饰及功能
  第二节  测序技术在表观遗传修饰中的应用
  第三节  蛋白质组学在表现遗传修饰中的应用
第十一章  系统生物学与进化理论
  第一节  进化理论简要历史
  第二节  自然选择理论或综合进化论
  第三节  分子钟和中性进化理论
  第四节  遗传多样性上限理论
  第五节  分子进化树原理
  第六节  人类起源与进化
  第七节  结语
结  论
参考文献