译者序
原著前言
第一篇 综述
第1章 硝化作用的研究现状
1.1 氨循环中的硝化作用
1.2 硝化微生物
1.3 硝化作用在过去25年里的发展
1.4 硝化作用研究的前景
第二篇 氨氧化细菌
第2章 氨氧化细菌:生物化学和分子生物学
2.1 引言
2.2 氨——一种能量源
2.3 氨单加氧酶
2.4 羟氨氧化还原酶
2.5 中心碳代谢
2.6 生物合成及运输
2.7 展望
第3章 氨氧化细菌的多样性及其在环境中的分布
3.1 引言
3.2 好氧氨氧化细菌的系统发展史和分类学
3.3 好氧氨氧化细菌的环境分布及生物地理学
3.4 原生和次生演替期间的氨氧化细菌群落
3.5 好氧氨氧化细菌生物地理学的展望
第4章 氨氧化细菌的基因组学及其进化
4.1 引言
4.2 有氧氧化氨生成亚硝酸盐细菌的基因组学
4.3 硝化作用库的分子进化
4.4 总结和展望
第5章 异养硝化和硝化细菌反硝化
5.1 引言
5.2 异养硝化作用
5.3 硝化细菌的反硝化作用
5.4 展望
第三篇 氨氧化古菌
第6章 氨氧化古菌的生理学和基因组学
6.1 引言
6.2 生理与超微结构
6.3 氨氧化古菌的基因组分析
6.4 进化
6.5 结论与展望
第7章 氨氧化古菌在自然环境中的分布和活性
7.1 古菌:生物地球化学循环中的重要组成
7.2 群体基因组学(宏基因组学)
7.3 氨氧化古菌的多样性和分布
7.4 不同环境中氨氧化古菌的活性
7.5 结论
第四篇 厌氧氨氧化(ANAMMOX)
第8章 厌氧氨氧化菌的代谢和基因组学
8.1 引言
8.2 厌氧氨氧化菌的生理学
8.3 厌氧氨氧化菌的细胞生物学
8.4 厌氧氨氧化菌的基因组学
8.5 厌氧氨氧化过程中的生物学及生物能学
8.6 展望
第9章 水生环境中厌氧氨氧化菌的分布、活性和生态学特性
9.1 引言
9.2 水生生态系统中厌氧氨氧化的生态学意义
9.3 水体沉积物中的厌氧氨氧化反应
9.4 海洋最低含氧区(OMZs)的厌氧氨氧化
9.5 全球底栖和深海中的氮预算
第10章 厌氧氨氧化反应过程的应用
10.1 引言
10.2 生理学
10.3 脱氨过程
10.4 测量与控制
10.5 启动时间和策略
10.6 可处理的废水
10.7 描述性术语
10.8 环境影响
10.9 数学模型
10.10 当前发展状况:实际规模反应器
10.11 展望
第五篇 亚硝酸盐氧化细菌
第11章 亚硝酸盐氧化细菌的代谢及基因组学:重点研究纯培养和硝化杆菌
11.1 引言
11.2 分类学/系统学
11.3 硝化杆菌基因组
11.4 亚硝酸盐氧化细菌的超微结构
11.5 生长特征
11.6 生理和代谢
11.7 异化硝酸盐还原
11.8 氮同化的生物合成
11.9 碳的储存和代谢
11.10 亚硝酸盐氧化细菌和氨氧化细菌共培养时亚硝酸盐氧化细菌的行为
11.11 结论及启示
第12章 亚硝酸盐氧化细菌的多样性、环境基因组学和生理生态学
12.1 引言
12.2 亚硝酸盐氧化细菌多样性和环境分布
12.3 硝化杆菌和硝化螺旋菌的生理生态学和生态位分离
12.4 “Candidatus Nitrospira defluvii”的环境基因组和全基因分析
第六篇 过程、生态学和生态系统
第13章 海洋中的硝化作用
13.1 引言
13.2 海洋中硝化作用的分布和速率
13.3 氨氧化细菌和氨氧化古菌
13.4 海洋中的亚硝酸盐氧化细菌
13.5 海洋中硝化细菌的生理学和生态学
13.6 海洋中的碳、氨通量
13.7 最小含氧区中的氧化亚氨及氦循环
13.8 传统硝化过程和厌氧氨氧化之间的关系
13.9 未来发展方向
第14章 土壤中硝化菌和硝化作用
14.1 引言
14.2 土壤硝化菌的群落组成
14.3 表面附着
14.4 底物供应
14.5 土壤pH
14.6 土壤结构、异质性和微环境
14.7 温度和二氧化碳对硝化作用的影响
14.8 硝化作用抑制剂
14.9 当前问题与未来研究
14.10 方法
第15章 内陆水中的硝化作用
15.1 引言
15.2 湖泊中的硝化作用
15.3 溪流和河流中的硝化作用
15.4 淡水中氨氧化细菌的谱系
15.5 湖泊中的谱系分离
15.6 河流中的谱系分离
15.7 结论
第16章 废水处理中的硝化作用
16.1 引言
16.2 活性污泥系统
16.3 生物膜系统
16.4 建模
16.5 结论与展望
16.6 结束语
参考文献