第一篇  古DNA理论基础
  第1章  古DNA与生物演化
    1.1  生物演化的宏观实证——化石记录
    1.2  生物大分子
    1.3  分子进化树及其构建原理
  第2章  古DNA的降解与保存
    2.1  古DNA的降解途径
    2.2  古DNA保存条件
    2.3  古DNA研究材料类型
  第3章  古DNA研究简史
    3.1  古DNA萌芽阶段(1980—1995年)
    3.2  古DNA发展阶段(1996—2005年)
    3.3  古DNA成熟阶段(2006年至今)
第二篇  古DNA研究方法
  第4章  古DNA实验室污染及防范
    4.1  污染源
    4.2  污染防范条例
    4.3  古DNA实验室建立与使用
  第5章  一代测序技术与古DNA
    5.1  古DNA提取
    5.2  PCR扩增
    5.3  PCR扩增产物的电泳检测与纯化
    5.4  分子克隆
    5.5  序列测定与拼接
    5.6  系统发育分析
  第6章  二代测序平台与古基因组
    6.1  二代测序文库
    6.2  古DNA富集
    6.3  二代测序及技术平台
    6.4  二代测序数据处理
    6.5  古基因组分析
第三篇  古DNA研究实例
  第7章  猛犸象
    7.1  长鼻目的演化与分类
    7.2  猛犸象与现生象类系统演化关系争议
    7.3  猛犸象古DNA研究
  第8章  披毛犀
    8.1  腔齿犀属的演化
    8.2  披毛犀的分布
    8.3  披毛犀的古DNA研究
  第9章  斑鬣狗
    9.1  鬣狗科的演化和分类
    9.2  鬣狗科系统演化争议
    9.3  斑鬣狗化石记录
    9.4  斑鬣狗古DNA研究
  第10章  猪科动物
    10.1  家猪起源和驯化
    10.2  家猪的扩散路线
    10.3  中国广西地区猪科动物古DNA研究实例
  第11章  马科动物
    11.1  马科动物的起源、扩散与演化
    11.2  马属动物演化的分子古基因组研究
    11.3  中国马属动物的古DNA研究现状
  第12章  大熊猫
    12.1  大熊猫的演化与分类地位
    12.2  大熊猫的地史分布
    12.3  大熊猫演化争议
    12.4  大熊猫古DNA研究
  第13章  骆驼
    13.1  骆驼科动物的起源和演化
    13.2  家养双峰驼和野生双峰驼进化关系的界定
    13.3  骆驼古DNA研究
  第14章  古人类
    14.1  人类的起源与演化简史
    14.2  两派假说与现代人类起源
    14.3  人类古DNA研究实例